两者的关系无外乎3点
1：行业垂直搜索成为B2B网站行业应用的信息堆积辅助工具
2：B2B网站行业应用成为行业搜索引擎的用户黏合剂
3：行业垂直搜索和B2B行业应用相互融合，两者相互促进
这三点在互联网的表现形式上几乎是相同的，但根据业务的侧重不同，运营方式和盈利方式会有很大的不同。
第一点：是通过提供全面的细致的行业服务发展企业用户，主要盈利模式有会员服务费，广告费
这种方式的优势是：管理简单，所提供的服务具有很强的针对性，站内信息的有效性很高。
缺点是：
1.搜索引擎产生的信息相对独立，很难融合到网站自身的行业应用中
2.在整个行业内部，各B2B网站行业应用重叠，各自为战，信息共享只是表面形式，相互竞争激烈
第二点：网站是靠传统的搜索引擎运营方式发展，主要盈利模式来源是广告，关键词等
这种方式的主要优势是：管理简单，信息量大。
缺点是：
1.行业的网站数量需要到达一定程度，搜索引擎才有意义
2.对行业宿主网站的依赖性强
3.服务内容单一，盈利模式单一
第三点：通过搜索引擎和站内的业务应用，提供大量的行业的信息，并对企业提供服务，盈利模式非常丰富无疑，这种方式才是真正的B2B行业搜索门户，但是真正的让搜索引擎的结果信息融入到网站的应用中，并非易事。线上，如果我们简单的搜索结果呈现给用户，那么和传统的行业搜索没有区别，那么怎么才能让大量的搜索结果信息同网站B2B业务信息一样，成为实时，互动的消息；线下，我们怎样整合网站和搜索引擎的信息，更好的为企业用户提供服务，都需要我们去摸索，探讨。如果真正能做到这种程度，我想，B2B行业搜索门户的前景是不言而喻的
目前，大多数B2B行业搜索门户存在的形式都和第一点和第二点类似，鞋商网正在探索一条真正的行业服务门户道路，而且坚信在我们的不懈努力下，使我们的客户真正的在体会门户式的，一站式的服务。
